Datenmanagement
Das Sichern der Logfiles aus den fMRT Paradigmen, sowie eine sinngemäße Dokumentation obliegt der Verantwortung der Studienleiter:innen.
Wie kommen Sie zu Ihren Daten?
MR-Daten werden ausschließlich im BIDS-Format ausgegeben. Im Zuge der BIDS-Konvertierung werden nur die für die Auswertung relevanten Metadaten (DICOM-Header) separat gespeichert. Die BIDS-Daten sind im NIfTI-Format verfügbar.
Aufbereitete BIDS-Daten können Instituts-intern direkt an die entsprechenden Netzwerkfreigaben der Arbeitsbereiche weitergeleitet werden. Somit kann innerhalb eines Arbeitsbereichs mit gültigem Uni-Graz Bediensteten Account jederzeit auf MR-Daten zugegriffen werden (ausschließlich BIDS-Format). Studienleiter:innen werden dazu angehalten die Daten selbst zu überprüfen.
Für externe Kooperationspartner:innen werden die Daten im Labor gegengesichert (ausschließlich BIDS-Format).
Die auf den Stimulus PCs erzeugten Daten (fMRT logfiles, fMRT eventfiles etc.) sind nur auf diesen gespeichert und können jederzeit gegengesichert werden. Da diese Daten nur in einer Instanz verfügbar sind empfiehlt es sich diese noch am selben Tag zu sichern.
Studienleiter:innen bekommen zu keinem Zeitpunkt DICOM-Daten!
PRISM Studio – Der empfohlene Workflow für Forschungsdaten
Für alle neuen Studien empfehlen wir die Verwendung von PRISM Studio zur Verwaltung und Aufbereitung von Forschungsdaten. PRISM Studio unterstützt Forschende dabei, Daten aus unterschiedlichen Quellen (z. B. LimeSurvey, Excel oder CSV) in eine standardisierte, BIDS-kompatible Projektstruktur zu überführen. Darüber hinaus erleichtert die Software die Validierung, Dokumentation, Anonymisierung und den Export von Datensätzen und trägt so zu einer reproduzierbaren und nachhaltigen Forschungsdatenverwaltung bei.
Die Nutzung von PRISM Studio vereinfacht den gesamten Datenmanagementprozess und stellt sicher, dass Studien von Beginn an nach einheitlichen Standards organisiert werden. Weitere Informationen sowie die Installationsdateien finden Sie im GitHub-Repository von PRISM Studio.
The study directors are responsible for saving the log files from the fMRI paradigms and documenting them appropriately.
How do you get your data?
MR data is only output in BIDS format. During the BIDS conversion, only the metadata relevant for the evaluation (DICOM header) is saved separately. The BIDS data is available in NIfTI format.
Processed BIDS data can be forwarded directly within the institute to the corresponding network shares of the work areas. This means that MR data can be accessed at any time within a work area with a valid Uni-Graz staff account (BIDS format only). Study directors are encouraged to check the data themselves.
For external cooperation partners, the data is cross-checked in the laboratory (BIDS format only).
The data generated on the stimulus PCs (fMRI logfiles, fMRI eventfiles etc.) are only stored on these and can be backed up at any time. Since this data is only available in one instance, it is recommended to back it up on the same day.
Study directors do not receive DICOM data at any time!
PRISM Studio – The Recommended Workflow for Research Data Management
For all new research projects, we strongly recommend the use of PRISM Studio for research data management and organization. PRISM Studio helps researchers consolidate data from multiple sources (e.g., LimeSurvey, Excel, or CSV files) into a standardized, BIDS-compliant project structure. In addition, it facilitates data validation, documentation, anonymization, and export, promoting reproducible and sustainable research practices.
Using PRISM Studio streamlines the entire data management workflow and ensures that studies are organized according to consistent standards from the very beginning. Further information, installation instructions, and source code are available in the PRISM Studio GitHub repository.